Altri principi attivi importanti contenuti nelle piante sono gli antibiotici.
Molti licheni hanno proprietà batteriostatiche e antifungine dovute alla presenza di acido usnico; l’aglio è antimicrobico grazie all’allicina; diverse Ranuncolaceae agiscono tramite un lattone, la protoanemonina, mentre alcune Crucifere agiscono tramite i loro derivati solforati. In molte Compositae, sono state messe in evidenza proprietà antibiotiche, in particolare nella bardana e nella pilosella.